Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP29O95721 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNAP29O95721 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms