Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCNKO75909 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCNKO75909 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNKO75909 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCNKO75909 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCNKO75909 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCNKO75909 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNKO75909 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNKO75909 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms