Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OFD1O75665 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OFD1O75665 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OFD1O75665 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OFD1O75665 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OFD1O75665 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OFD1O75665 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OFD1O75665 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OFD1O75665 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OFD1O75665 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms