Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX3O75364 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms