Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP2O75323 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP2O75323 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms