Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTSVO60911 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTSVO60911 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTSVO60911 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTSVO60911 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTSVO60911 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms