Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR2O43760 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms