Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -01e-8■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ARHGEF1-222ENST00000600517 428 ntTSL 310.44□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 216.73■□□□□ 0.271e-7■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.121e-7■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-209ENST00000480417 777 ntTSL 217.91■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-207ENST00000463086 505 ntTSL 517.21■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-212ENST00000485320 2357 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 212.75□□□□□ -0.379e-8■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 DNM2-214ENST00000590787 4299 ntTSL 29.8□□□□□ -0.849e-8■■■■□ 24.1
RBFOX2O43251 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 213.87□□□□□ -0.197e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 212□□□□□ -0.497e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 511.51□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 210.85□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-222ENST00000477937 410 ntTSL 510.58□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.757e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 521.92■■□□□ 1.13e-11■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HAGHL-217ENST00000569143 564 ntTSL 415.71■□□□□ 0.112e-10■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HAGHL-214ENST00000567414 735 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-10■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HAGHL-207ENST00000561750 675 ntTSL 214.75□□□□□ -0.052e-10■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HAGHL-208ENST00000562141 650 ntTSL 513.09□□□□□ -0.312e-10■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HAGHL-209ENST00000562187 100 ntTSL 310.62□□□□□ -0.712e-10■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-11■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-11■■■■□ 24
RBFOX2O43251 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 514.55□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 24
RBFOX2O43251 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.376e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FGFR4-213ENST00000511076 838 ntTSL 515.35■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-213ENST00000455233 671 ntTSL 313.96□□□□□ -0.176e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-212ENST00000454279 565 ntTSL 313.91□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.216e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MUM1-211ENST00000591433 2603 ntTSL 513.29□□□□□ -0.286e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 GTSE1-203ENST00000479645 1111 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ZNF518A-205ENST00000488700 729 ntTSL 213□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MUM1-205ENST00000587460 2793 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 HS3ST3B1-202ENST00000466596 2808 ntTSL 212.59□□□□□ -0.396e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.396e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.456e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-211ENST00000451475 544 ntTSL 511.99□□□□□ -0.496e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-206ENST00000437711 753 ntTSL 511.99□□□□□ -0.496e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.634e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.666e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-205ENST00000411478 568 ntTSL 410.76□□□□□ -0.696e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.714e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.746e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 GINS1-204ENST00000484893 583 ntTSL 510.28□□□□□ -0.766e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.794e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 29.95□□□□□ -0.826e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MUM1-204ENST00000586996 574 ntTSL 49.81□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-204ENST00000376138 3503 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.844e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.853e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.876e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.956e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.976e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-201ENST00000346832 3289 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.094e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-8■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.26e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.214e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.244e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.254e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.266e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.366e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ENPP3-205ENST00000427707 1536 ntTSL 1 (best)6.31□□□□□ -1.46e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.453e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.464e-9■■■■□ 24
RBFOX2O43251 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 25.93□□□□□ -1.466e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ZNF518A-208ENST00000563195 1594 ntTSL 35.93□□□□□ -1.466e-7■■■■□ 24
RBFOX2O43251 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.496e-7■■■■□ 24
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