Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1L1O43166 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1L1O43166 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms