Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEFVO15553 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEFVO15553 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEFVO15553 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEFVO15553 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms