Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms