Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLGNO14967 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLGNO14967 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLGNO14967 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLGNO14967 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLGNO14967 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLGNO14967 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms