Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF5O00463 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF5O00463 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms