Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CDO00329 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms