Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP73A6NFT4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms