Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6L4A6NEF3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms