Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms