Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms