Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A0A0U1RRA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A0A0U1RRA0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms