Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms