Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAMTA1Q9Y6Y1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms