Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AUP1Q9Y679 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AUP1Q9Y679 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms