Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms