Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms