Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRELID3BQ9Y3B1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms