Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP20Q9Y2K6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP20Q9Y2K6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms