Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTX4Q9Y2E6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms