Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD1AQ9Y241 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms