Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNQ9UQP3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNQ9UQP3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms