Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVW-1Q9UQF0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms