Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS5Q9UPZ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPS5Q9UPZ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms