Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRQQ9UMZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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