Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPCN1Q9ULQ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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