Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO3Q9UK99 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO3Q9UK99 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO3Q9UK99 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO3Q9UK99 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO3Q9UK99 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms