Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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