Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP25Q9UHP3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP25Q9UHP3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms