Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCSK1NQ9UHG2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK1NQ9UHG2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms