Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SWAP70Q9UH65 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWAP70Q9UH65 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms