Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS7AQ9UBW8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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