Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLKQ9UBT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms