Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC6Q9UBN7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC6Q9UBN7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms