Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-18Q9QC07 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK-18Q9QC07 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms