Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MBD5Q9P267 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MBD5Q9P267 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms