Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EHD3Q9NZN3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms