Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND1Q9NSA2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms