Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM1Q9NRU3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms