Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-204ENST00000554598 772 ntTSL 227.99■■■□□ 2.072e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM129-205ENST00000480360 761 ntTSL 326.57■■□□□ 1.842e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.782e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-206ENST00000555148 2349 ntTSL 225.76■■□□□ 1.712e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.72e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-208ENST00000556318 518 ntTSL 425.66■■□□□ 1.72e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 MARCH7-205ENST00000421037 559 ntTSL 421.76■■□□□ 1.072e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 MARCH7-207ENST00000473749 821 ntTSL 318.91■□□□□ 0.622e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-207ENST00000555749 594 ntTSL 218.89■□□□□ 0.612e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 MARCH7-209ENST00000539065 3303 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.252e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.662e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-239ENST00000583859 567 ntTSL 539.08■■■■□ 3.851e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-203ENST00000391844 1795 ntTSL 1 (best)37.1■■■■□ 3.531e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.244e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 334.06■■■■□ 3.041e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.774e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.571e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-240ENST00000584288 1706 ntTSL 229.6■■■□□ 2.331e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.184e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.981e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.921e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC19.96■□□□□ 0.794e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.614e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-213ENST00000452077 577 ntTSL 318.74■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 20.1
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DROSHAQ9NRR4 AKT2-241ENST00000596634 583 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-202ENST00000358335 546 ntTSL 415.62■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 AKT2-209ENST00000423127 798 ntTSL 514.97□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.394e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.544e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.994e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G3-209ENST00000515322 1115 ntTSL 52.31□□□□□ -2.044e-6■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 238.62■■■■□ 3.774e-10■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.253e-8■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.233e-8■■■■□ 20.1
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.163e-8■■■■□ 20.1
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DROSHAQ9NRR4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-9■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-9■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.083e-9■■■■□ 20
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DROSHAQ9NRR4 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.013e-9■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 538.56■■■■□ 3.768e-7■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.578e-7■■■■□ 20
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DROSHAQ9NRR4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.178e-7■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.928e-7■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 219.37■□□□□ 0.698e-7■■■■□ 20
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DROSHAQ9NRR4 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 229.99■■■□□ 2.391e-6■■■■□ 20
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DROSHAQ9NRR4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.699e-8■■■■□ 20
DROSHAQ9NRR4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.619e-8■■■■□ 20
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DROSHAQ9NRR4 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 227.46■■□□□ 1.991e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.821e-11■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.671e-11■■■■□ 19.9
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DROSHAQ9NRR4 AP1G2-223ENST00000556277 891 ntTSL 525.04■■□□□ 1.64e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-207ENST00000553685 561 ntTSL 1 (best)24.06■■□□□ 1.444e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-225ENST00000556743 1456 ntTSL 1 (best)23.4■■□□□ 1.344e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-206ENST00000553629 1301 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.24e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-226ENST00000556843 562 ntTSL 422.04■■□□□ 1.124e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-233ENST00000557482 728 ntTSL 521.43■■□□□ 1.024e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-209ENST00000554069 755 ntTSL 321.43■■□□□ 1.024e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-234ENST00000557619 1004 ntTSL 220.34■□□□□ 0.854e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-208ENST00000553756 656 ntTSL 320.13■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.774e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-213ENST00000554816 297 ntTSL 418.93■□□□□ 0.624e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-205ENST00000535852 2471 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-227ENST00000556943 747 ntTSL 318.52■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.454e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-220ENST00000555896 927 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 418.19■□□□□ 0.58e-8■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 313.44□□□□□ -0.266e-9■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 HERC4-212ENST00000505760 578 ntTSL 438.56■■■■□ 3.761e-7■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.441e-6■■■■□ 19.9
DROSHAQ9NRR4 ULK1-202ENST00000537421 959 ntTSL 319.2■□□□□ 0.664e-7■■■■□ 19.8
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