Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHST12Q9NRB3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms