Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELL3Q9HB65 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELL3Q9HB65 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms