Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCSER2Q9H7U1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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